Детективы и фантастика

События фильма происходят спустя шесть лет после финала сериала. Молодую женщину похищают в её деревенском доме в городке Сомерсет в Западной Вирджинии. Одновременно с похищением мы видим сотрудников ФБР, которые что-то ищут в заснеженном поле. Их ведёт за собой длинноволосый человек в очках, который в конце концов находит в снегу отрезанную человеческую руку.

Бывший специальный агент ФБР Дана Скалли работает врачом в католическом госпитале Our Lady of Sorrows (Богоматерь Скорбящая). Её пациент — мальчик по имени Кристиан с неизлечимой болезнью мозга. Агент ФБР Мосли Драмми приходит к ней и просит помочь связаться с Фоксом Малдером, который ранее возглавлял отдел секретных материалов. Драмми заявляет, что за помощь в расследовании исчезновения своего агента ФБР готово снять с Малдера обвинения и прекратить преследование. Скалли соглашается и убеждает Малдера, который живёт неподалёку в небольшом доме, собирая вырезки статей о паранормальных явлениях, помочь ФБР в расследовании. Малдер предполагает, что это очередной трюк ФБР с целью выманить его, однако Скалли замечает, что ФБР давно бы это сделало, но этой организации гораздо легче просто игнорировать его существование.

Оба, Малдер и Скалли, прилетают в Вашингтон, где их встречает агент Дакота Уитни. В бытность агентом ФБР Малдеру приходилось работать с людьми, обладающими экстрасенсорными возможностями, и помогавшими ему в расследованиях. Внимательно изучив некоторые из этих дел, которые когда-то вел Малдер, Уитни хочет, чтобы он, на основе своего опыта, высказал своё мнение о человеке, который привёл их к страшной находке, возможно, имеющей отношение к пропавшим женщинам. Это бывший священник, отец Джозеф Фицпатрик Криссман (Билли Коннолли), после отбывания срока за педофилию проживающий в своеобразном «колонии-поселении». Криссман утверждает, что «видит» преступления. Малдер готов поверить ему, но Скалли, у которой прошлое Криссмана вызывает отвращение, не придаёт значения этим «видениям».

Очередной жертвой похищения становится женщина, которая едет домой из бассейна. Её автомобиль вылетает с дороги, сбитый машиной, водитель которой — Янке Дачишин — разбив стекло, похищает женщину. Уитни и Драмми отвозят Криссмана и Малдера к дому похищенного агента Бюро Моники Бэнон, где бывший священник, сражённый очередным видением, падает на колени, и из его глаз на снег капает кровь.

На следующее утро Скалли и Малдер, лёжа в постели, кратко упоминают их сына, Уильяма, и обсуждают дело ФБР и пациента Скалли. Скалли говорит, что в тканях найденной руки она нашла следы транквилизатора для животных. Это придаёт энергии Малдеру, и он едет в ФБР. С помощью Криссмана они находят во льду огромную могилу из останков человеческих тел. Анализ останков приводит их к Дачишину, который занимается экспортом донорских органов в Ричмонд, и к его мужу, Францу Томчешину, который когда-то был одним из «мальчиков» Криссмана.